Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB2BQ9BVA1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms