Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFAF3Q9BU61 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms