Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP3BQ9BS92 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms