Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GINS3Q9BRX5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS3Q9BRX5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms