Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SEMA3CQ99985 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms