Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD9AQ99638 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms