Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
EIF3CQ99613 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF3CQ99613 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms