Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PIK3R4Q99570 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PIK3R4Q99570 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms