Protein–RNA interactions for Protein: Q99325

ATG40, Autophagy-related protein 40, yeastyeast

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG40Q99325 YDR008CYDR008C 351 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 YOR248WYOR248W 303 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 SVS1YPL163C 783 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 TOF2YKR010C 2316 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 APL3YBL037W 3078 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 OCA6YDR067C 675 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 NUT2YPR168W 474 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 NUT1YGL151W 3399 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 PIG1YLR273C 1947 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 SPO23YBR250W 1572 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 YDR029WYDR029W 315 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 YER135CYER135C 393 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 YKL123WYKL123W 381 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 PAU24YBR301W 363 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 IFH1YLR223C 3258 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 LYS14YDR034C 2373 nt0.75□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 NOC3YLR002C 1992 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 HUR1YGL168W 333 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 TMA22YJR014W 597 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 PXA2YKL188C 2562 nt0.74□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 SDH2YLL041C 801 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 RUF22RUF22 515 nt0.73□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 MPT5YGL178W 2580 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 ILM1YJR118C 612 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 IRC23YOR044W 474 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 SEC3YER008C 4011 nt0.72□□□□□ -2.29
ATG40Q99325 SCW11YGL028C 1629 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 YDR114CYDR114C 303 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 YGR025WYGR025W 303 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 HIT1YJR055W 495 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 RPL32YBL092W 393 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 AIM9YER080W 1884 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 SET3YKR029C 2256 nt0.71□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 snR13snR13 124 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 SLD3YGL113W 2007 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 ENV11YGR071C 2583 nt0.7□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 NUP145YGL092W 3954 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 MET32YDR253C 576 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 CYC7YEL039C 342 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 YAP3YHL009C 993 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 APQ13YJL075C 417 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 PAM16YJL104W 450 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 YBR012CYBR012C 420 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 RCN2YOR220W 798 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 TSC3YBR058C-A 243 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 YLL032CYLL032C 2478 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 YCS4YLR272C 3531 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 NBL1YHR199C-A 222 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 RPL16AYIL133C 600 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 FIG4YNL325C 2640 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 KAP120YPL125W 3099 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 STO1YMR125W 2586 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 YGR045CYGR045C 363 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 PHS1YJL097W 654 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 MRPL31YKL138C 396 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 GPI15YNL038W 690 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 SAS3YBL052C 2496 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 UBP3YER151C 2739 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 UPS1YLR193C 528 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 RFX1YLR176C 2436 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 APL2YKL135C 2181 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 AIM44YPL158C 2277 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG40Q99325 SWI6YLR182W 2412 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 RPL9AYGL147C 576 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YGL239CYGL239C 315 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 SEC1YDR164C 2175 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 RPF1YHR088W 888 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 URM1YIL008W 300 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YLR269CYLR269C 351 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 NUP157YER105C 4176 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 MXR1YER042W 555 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 RKR1YMR247C 4689 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 LCD1YDR499W 2244 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 SLY1YDR189W 2001 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YDL206WYDL206W 2289 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YDR269CYDR269C 324 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 RRT1YBL048W 312 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YOR199WYOR199W 330 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 PDE2YOR360C 1581 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YCR001WYCR001W 315 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 NHP2YDL208W 471 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 BIG1YHR101C 1008 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YIL059CYIL059C 366 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG40Q99325 ALY2YJL084C 3141 nt0.6□□□□□ -2.31
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