Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms