Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPNS2Q96L46 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms