Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GJD4Q96KN9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms