Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms