Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms