Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM18Q96B42 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms