Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UTP4Q969X6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms