Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-CQ95604 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms