Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAT3Q8TDW7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
FAT3Q8TDW7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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