Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 FCGR3A-206ENST00000443193 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SVIPQ8NHG7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms