Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00116Q8NCU8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms