Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms