Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT27Q7Z3Y8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms