Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRCAPQ6ZRS2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms