Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM136Q6ZRR5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms