Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1LQ6UX01 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1LQ6UX01 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms