Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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