Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRSAM1Q6UWE0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms