Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC102BQ68D86 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102BQ68D86 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102BQ68D86 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102BQ68D86 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102BQ68D86 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102BQ68D86 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102BQ68D86 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102BQ68D86 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC102BQ68D86 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms