Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HABP4Q5JVS0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms