Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CMPK2Q5EBM0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CMPK2Q5EBM0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms