Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC93Q567U6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms