Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA8Q53HL2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDCA8Q53HL2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDCA8Q53HL2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms