Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SWI5Q1ZZU3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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