Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPP1Q1MSJ5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSPP1Q1MSJ5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
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