Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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GEN1Q17RS7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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GEN1Q17RS7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GEN1Q17RS7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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