Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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