Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF239Q16600 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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