Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLFQ16534 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLFQ16534 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLFQ16534 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLFQ16534 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLFQ16534 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HLFQ16534 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLFQ16534 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLFQ16534 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLFQ16534 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLFQ16534 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLFQ16534 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLFQ16534 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLFQ16534 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLFQ16534 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLFQ16534 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLFQ16534 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLFQ16534 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HLFQ16534 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HLFQ16534 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms