Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CRY1Q16526 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRY1Q16526 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms