Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SNCBQ16143 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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