Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA2Q15822 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA2Q15822 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms