Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM1Q15629 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
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