Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRADDQ15628 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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