Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CYTH1Q15438 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH1Q15438 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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