Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSHL1Q14406 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms