Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL1Q13616 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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