Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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