Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PICALMQ13492 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
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