Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXE3Q13461 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXE3Q13461 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXE3Q13461 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXE3Q13461 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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FOXE3Q13461 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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FOXE3Q13461 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXE3Q13461 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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