Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IKZF1Q13422 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IKZF1Q13422 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
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